1960年代美国受越战影响财政紧张，中美关系在1970年代缓和后，美国开始战略收缩，在海外部署的核武器也开始撤走，部署在韩国的核武器陆续也开始撤离。到1991年美国算是全部从韩国撤走了核武器。然而，为了避免影响美韩同盟，美国对是否将在韩部署的核武器撤离一直讳莫如深，直到1998年美国太平洋司令部的一份解密文件才对外证实，美军确实在1991年12月31日前撤出在韩国的最后一件核武器。
 
1991年底，朝鲜半岛北南双方签署了互不侵犯协定；韩国政府宣布韩国不存在任何核武器，表明美国已经完全撤除其部署的核武器。朝韩双方签署了《朝鲜半岛无核化宣言》。1992年1月底，朝鲜与国际原子能机构（IAEA）签署了接受安全保障协议。1992年5月至1993年2月，朝鲜接受了国际原子能机构（IAEA）6次不定期核检查。但是，1992年下半年，国际原子能机构（IAEA）与朝鲜就视察问题出现摩擦。1993年3月12日，朝鲜第一次宣布退出《不扩散核武器条约》。在朝鲜的宣布生效之前，美国和朝鲜进行了副部长级的谈判，并于1993年6月11日达成一个联合声明。1994年5月30日，联合国安理会提出对朝鲜进行核项目调查并对其进行制裁。1994年6月，美国前总统卡特前往平壤斡旋，与朝鲜政府达成了《朝核问题框架协定》，此一协议是朝鲜核危机的直接渊源。按照《朝核问题框架协定》的要求，朝鲜必须冻结其各种核项目，并在所有核设施上加装监控系统，禁止一切关闭项目的重启。因担心朝鲜发展核武器，1994年10月21日，美国与朝鲜在日内瓦签署了一项关于朝核问题的《朝美核框架协议》，朝鲜冻结其核设施，美国牵头成立朝鲜半岛能源开发组织，负责为朝鲜建造轻水反应堆并提供重油，以弥补朝鲜停止核能计划造成的电力损失。此后，宁边5兆瓦反应堆中8000根废燃料棒被取出封存。然而，美、日、韩三国协助朝鲜拆卸石墨反应堆并帮助朝鲜建设两座轻水反应堆的承诺一拖再拖。这两座反应堆的发电能力约为2千兆瓦。2001年，美国总统乔治·沃克·布什（GeorgeWalkerBush）上台后，美国对朝政策变为强硬，并于2002年初将朝鲜与伊朗、伊拉克一起称为“邪恶轴心”，媒体披露的美国《核态势审议报告》也将朝鲜列为使用核武器的对象之一。

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